Nosso trato gastrointestinal possui uma comunidade de vários microorganismos (vírus, fungos, protozoários e etc). Essa comunidade é diferente em cada pessoa e tem ação em diversas funções do nosso corpo: motilidade intestinal, sinalização de informações para o cérebro, regulação do sistema imune, controle de microorganismos nocivos, absorção de nutrientes, produção de vitaminas e metabolismo.

Portanto, saber quem são e como cuidar dessa comunidade pode ajudar diretamente na saúde e na prevenção de doenças. Além de  auxiliar em um diagnóstico mais preciso, na escolha da dieta e do tratamento e em orientações mais específicas.

Esse exame detecta  agentes patogênicos que possam estar afetando o equilíbrio microbiótico normal ou contribuindo com doenças. Entre eles: bactérias, como H.Pylori, vírus, fungos e  parasitas comensais e oportunistas. Também pesquisa genes associados à resistência aos antibióticos.